夏の高校野球選手権の組み合わせにも重要な、高校野球春季大会。
2021年度長崎県大会は、3月25日（木）に開幕し決勝戦は4月11日（日）におこなわれました。
組合せ・結果
1回戦
| 上対馬 平戸 猶興館 |
0 | 佐世保工 | 3 | |
| 長崎南山 | 11 | 波佐見 | 2 | |
| 上五島 | 6 | 島原工 | 1 | |
| 西陵 | 0 | 鎮西学院 | 15 | |
| 諫商 翔南 国見 |
11 | 壱岐 | 12 | |
| 長崎鶴洋 西彼杵 |
1 | 清峰 | 2 | |
| 五島海陽 | 9 | 大村 | 6 | |
| 対馬 | 1 | 壱岐商 | 5 | |
| 口加 | 0 | 長崎東 | 7 | |
| 諫早農 | 13 | 島原 | 8 | |
| 長総大附 | 2 | 長崎南 | 7 | |
| 九州文化学 | 6 | 諫早東 | 0 | |
| 小浜 | 10 | 鹿町工 | 8 | |
| 佐世保西 | 0 | 長崎明誠 | 2 | |
| 松浦 | 0 | 西海学園 | 4 | |
| 島原中央 | 7 | 佐世保南 | 1 | |
| 長崎北陽台 | 2 | 長崎北 | 5 | |
| 諫早 | 3 | 長崎工 | 12 |
2回戦
| 長崎日本大 | 6 | 長崎西 | 4 | |
| 長崎南山 | 1 | 佐世保工 | 8 | |
| 上五島 | 2 | 鎮西学院 | 2 | |
| 川棚 | 6 | 佐世保実 | 3 | |
| 諫商 翔南 国見 |
8 | 五島 | 11 | |
| 五島海陽 | 7 | 壱岐 | 6 | |
| 諫早農 | 12 | 大村 | 0 | |
| 島原農 | 2 | 長崎商 | 10 | |
| 創成館 | 5 | 瓊浦 | 1 | |
| 九州文化学 | 0 | 島原 | 8 | |
| 小浜 | 11 | 長崎南 | 1 | |
| 佐世保高専 | 0 | 鹿町工 | 11 | |
| 佐世保北 | 9 | 佐世保商 | 2 | |
| 島原中央 | 7 | 西海学園 | 16 | |
| 諫早 | 0 | 長崎工 | 0 | |
| 大村工 | 7 | 海星 | 4 |
3回戦
| 長崎日本大 | 5 | 佐世保工 | 4 | |
| 川棚 | 3 | 佐世保実 | 9 | |
| 諫商 翔南 国見 |
1 | 五島 | 3 | |
| 諫早農 | 8 | 長崎商 | 6 | |
| 創成館 | 3 | 島原 | 0 | |
| 小浜 | 4 | 鹿町工 | 6 | |
| 佐世保北 | 3 | 西海学園 | 3 | |
| 大村工 | 2 | 海星 | 10 |
準々決勝
| 長崎日本大 | 14 | 佐世保実 | 1 | |
| 諫早農 | 8 | 長崎商 | 8 | |
| 小浜 | 3 | 鹿町工 | 1 | |
| 佐世保北 | 1 | 海星 | 9 |
準決勝
| 長崎日本大 | 5 | 長崎商 | 6 | |
| 小浜 | 6 | 海星 | 2 |
3位決定戦
| 長崎日本大 | 15 | 6 | 海星 |
決勝
| 小浜 | 2 | 3 | 長崎商 |
九州大会
秋季大会の結果
野球部の強い高校ランキング（長崎県）
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