新チーム最初の都道府県大会となる、高校野球秋季大会。
選抜高校野球大会出場への、重要な判断材料でもあります。
2020年度東京大会は、10月17日（土）に開幕し、決勝戦は11月15日におこなわれました。
組合せ・結果
1回戦2回戦3回戦準々決勝～
1回戦
※雨天のため17日（土）の試合は全て中止になりました。
10月18日（日）・19日（月）
| 東海大菅生 | 15 | 佼成学園 | 10 | |
| 本郷 | 1 | 小平西 | 0 | |
| 目黒日大 | 6 | 松原 | 1 | |
| 日野台 | 4 | 小松川 | 11 | |
| 錦城学園 | 3 | 岩倉 | 5 | |
| 東京成徳大 | 1 | 豊多摩 | 2 | |
| 桜美林 | 1 | 成立学園 | 4 | |
| 啓明学園 | 0 | 二松學舍大 | 6 | |
| 日大二 | 12 | 早稲田実 | 9 | |
| 目白研心 | 10 | 修徳 | 2 | |
| 小平 | 1 | 駒場学園 | 0 | |
| 早大学院 | 6 | 郁文館 | 11 | |
| 日本学園 | 2 | 成瀬 | 4 | |
| 立正大立正 | 0 | 上野学園 | 6 | |
| 八王子北 | 8 | 海城 | 1 | |
| 東亜学園 | 9 | 大森学園 | 9 | |
| 国士舘 | 12 | 創価 | 10 | |
| 立教池袋 | 2 | 文京 | 0 | |
| 八王子 | 11 | 専大付 | 5 | |
| 富士森 | 3 | 共栄学園 | 7 | |
| 日大鶴ヶ丘 | 1 | 明大中野八王子 | 8 | |
| 東大和 | 0 | 東京実 | 1 | |
| 東海高輪台 | 11 | 江戸川 | 0 | |
| 実践学園 | 4 | 日大豊山 | 9 | |
| 世田谷学園 | 1 | 日大三 | 13 | |
| 城西大城西 | 4 | 明法 | 3 | |
| 日野 | 13 | 東洋 | 5 | |
| 駒込 | 2 | 千歳丘 | 6 | |
| 國學久我山 | 17 | 小山台 | 10 | |
| 城北 | 18 | 青山学院 | 0 | |
| 駒大高 | 3 | 堀越 | 2 | |
| 関東一 | 5 | 帝京 | 4 |
2回戦
10月24日（土）・25日（日）
| 東海大菅生 | 10 | 佼成学園 | 32 | |
| 目黒日大 | 0 | 小松川 | 0 | |
| 錦城学園 | 0 | 岩倉 | 1 | |
| 桜美林 | 1 | 二松學舍大 | 9 | |
| 日大二 | 9 | 早稲田実 | 6 | |
| 早大学院 | 3 | 郁文館 | 2 | |
| 日本学園 | 12 | 上野学園 | 1 | |
| 東亜学園 | 7 | 大森学園 | 9 | |
| 国士舘 | 1 | 創価 | 7 | |
| 八王子 | 2 | 共栄学園 | 0 | |
| 日大鶴ヶ丘 | 14 | 明大中野八王子 | 3 | |
| 東海高輪台 | 6 | 日大豊山 | 4 | |
| 城西大城西 | 2 | 日大三 | 10 | |
| 日野 | 3 | 千歳丘 | 0 | |
| 城北 | 0 | 小山台 | 10 | |
| 関東一 | 5 | 帝京 | 0 |
3回戦
10月31日（土）・11月1日（日）
| 東海大菅生 | 10 | 佼成学園 | 0 | |
| 桜美林 | 2 | 二松學舍大 | 12 | |
| 日大二 | 16 | 早稲田実 | 7 | |
| 日本学園 | 0 | 大森学園 | 1 | |
| 八王子 | 3 | 創価 | 2 | |
| 日大鶴ヶ丘 | 1 | 日大豊山 | 4 | |
| 日野 | 1 | 日大三 | 1 | |
| 関東一 | 4 | 小山台 | 0 |
準々決勝
11月7日（土）・8日（日）
| 東海大菅生 | 5 | 二松學舍大 | 6 | |
| 日大二 | 1 | 早稲田実 | 4 | |
| 八王子 | 0 | 日大豊山 | 2 | |
| 関東一 | 7 | 日大三 | 6 |
準決勝
11月14日（土）
| 東海大菅生 | 7 | 二松學舍大 | 2 | |
| 関東一 | 5 | 日大三 | 3 |
決勝
11月15日（日）
| 東海大菅生 | 6 | 1 | 日大三 |
明治神宮野球大会
優勝校が、明治神宮野球大会へ推薦されます。
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